莲埭的命名缘于埭上自然村,百崎回族始祖郭仲远初到白崎铺即现在的百崎回族乡定居时就住在埭上村。埭上村原是一片海埭,西侧的海堤俗称郑和堤,乃永乐十五年(1417)郑和第五次下西洋在泉州逗留期间协助百崎回民所建,至此才截断滔滔江水。在建堤之前,每逢涨潮时海水经常漫道村部,举目一片汪洋。而郭仲远所择居住地俗称“莲花穴”,也称“竹排穴”,能随这潮水的涨退而升降,因此郭仲远一家得以安然无恙。后来埭上及周边几个自然村组成一个行政单位(或称乡或称大队或称村,现在称为行政村)。所以就以“莲埭”作为称谓,这个名称一直沿袭至今。实行保甲制时埭上与下埭联保,俗称联埭保,因“莲”与“联”同音,这又是“莲埭”缘起之一说。